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Acquisition initiale de microbiote

L'acquisition initiale de microbiote est la formation du microbiote d'un organisme immédiatement avant et après la naissance. Le microbiote (aussi appelé flore) est l'ensemble des micro-organismes dont les bactéries, les archées et les champignons qui colonisent l'organisme. Le microbiome est un autre terme pour le microbiote ou peut faire référence aux génomes collectés.

Bon nombre de ces micro-organismes interagissent avec l'hôte de manière bénéfique et jouent souvent un rôle essentiel dans des processus tels que la digestion et l'immunité[1]. Le microbiome est dynamique : il varie d'un individu à l'autre, au fil du temps, et peut être influencé à la fois par des forces endogènes et exogènes[2].

De nombreuses recherches chez les invertébrés[3],[4],[5] ont montré que les endosymbiotes peuvent être transmis verticalement aux ovocytes ou transmis de manière externe lors de la ponte[6]. Les recherches sur l'acquisition de communautés microbiennes chez les vertébrés sont relativement rares, mais suggèrent également qu'une transmission verticale peut se produire[7],[8].

  1. ↑ (en) Katherine Harmon, « Bugs Inside: What Happens When the Microbes That Keep Us Healthy Disappear? », Scientific American, .
  2. ↑ (en-GB) Smitha Mundasad, « Human Microbiome Project reveals largest microbial map », BBC News,‎ (lire en ligne, consulté le ).
  3. ↑ (en) Heike Feldhaar et Roy Gross, « Insects as hosts for mutualistic bacteria », International Journal of Medical Microbiology, vol. 299, no 1,‎ , p. 1–8 (PMID 18640072, PMCID 7172608, DOI 10.1016/j.ijmm.2008.05.010).
  4. ↑ (en) A.E. Douglas, « Mycetocyte symbiosis in insects », Biological Reviews, vol. 64, no 4,‎ , p. 409–434 (PMID 2696562, DOI 10.1111/j.1469-185X.1989.tb00682.x).
  5. ↑ (en) P. Buchner, Endosymbiosis of animals with plant microorganisms, New York, Interscience Publishers, (ISBN 978-0470115176).
  6. ↑ (en) Hassan Salem, « An out-of-body experience: the extracellular dimension for the transmission of mutualistic bacteria in insects », Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, vol. 282, no 1804,‎ , p. 20142957 (PMID 25740892, PMCID 4375872, DOI 10.1098/rspb.2014.2957).
  7. ↑ (en) Inne Gantois, Richard Ducatelle et Frank Pasmans, « Mechanisms of egg contamination by Salmonella Enteritidis », FEMS Microbiology Reviews, vol. 33, no 4,‎ , p. 718–738 (PMID 19207743, DOI 10.1111/j.1574-6976.2008.00161.x).
  8. ↑ (en) L.J. Funkhouser et S.R. Bordenstein, « Mom Knows Best: The Universality of Maternal Microbial Transmission », PLOS Biol, vol. 11, no 8,‎ , e1001631 (PMID 23976878, PMCID 3747981, DOI 10.1371/journal.pbio.1001631).

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